Комментарии на вашем сайте могут как помочь в продвижении вашего проекта, так и навредить. Рассмотрим сначала плюсы.

Начнем с того, что это совершенно бесплатный, и в большинстве случаев уникальный контент (если вебмастер за этим следит). А это значит, что для поисковиков это дополнительные тексты на вашем сайте, которые иногда попадают на более верхние позиции в выдаче по поисковым запросам, чем сама обсуждаемая статья. Кроме того, если комментарии максимально соответствуют теме самой статьи, это может повысить плотность ключевых слов естественным путем (главное, чтобы не чрезмерно). 

Еще один плюс - даже если посетитель не дочитает вашу статью до конца, он может заинтересоваться комментариями, начать их читать и, возможно, также захочет высказать свое мнение. То есть, задержится на вашем сайте дольше, чем планировал. При этом поисковые системы видят, что посетители находятся на вашем сайте долгое время, для них это знак, что людям интересна и полезна информация, находящаяся на этом ресурсе. А раз сайт настолько интересен, доверие поисковиков к нему повышается, и они начинают выводить его на более верхние позиции в поисковой выдаче. 

Также, многие посетители, оставив сообщение, часто подписываются на извещения об ответах на свой комментарий. Затем, получив уведомление на свой почтовый ящик, часто возвращаются на этот сайт, чтобы посмотреть, что думают по этому поводу другие пользователи. Таким образом, для владельца сайта это дополнительный трафик. Иногда, благодаря такой подписке, начинаются целые дискуссии, благодаря которым все остальные посетители могут узнать много новой и интересной информации, а тема статьи окажется максимально раскрытой. 

Но все это в идеале. Бывают и серьезные минусы.

Очень часто, страницей комментариев пользуются спамеры, то есть люди, которые оставляют различные сообщения со ссылками на собственные и чужие ресурсы. Причем эти сообщения являются неуникальными, ведь один и тот же текст эти люди размещают на десятках и даже сотнях разных сайтов. А так как поисковые системы очень не любят копипаст, то ваша страница может вообще вылететь из индекса поисковых систем из-за большого количества подобных неуникальных сообщений. Кроме того, если в комментариях присутствует прямая ссылка на чужой сайт, то с вашей страницы часть "веса" перетекает на посторонний ресурс. Также, в большинстве случаев, подобные комментарии даже близко не подходят к теме вашей статьи.

Еще одна крайность - плотность ключевых слов. Представьте, вы написали статью, создав идеальную плотность ключевых слов, и теперь ваш сайт находится на верхних позициях по определенным запросам. Комментарии, если они содержат информацию, совершенно далекую от темы статьи, могут сильно "разбавить" ваши ключевые слова. Например, к статье, в которой рассказывается об услугах хостинга, вдруг примешиваются сообщения о кулинарии, играх, обсуждения о форексе, выяснение отношений участников обсуждения и тому подобное.

Конечно, бывает и наоборот (хотя и очень редко) - в вашей статье рассказывается, например, о выводе средств с электронного кошелька вебмани. И вот, пользователи, заинтересовавшись этой темой, начинают бурно обсуждать эту тему и, допустим, почти в каждом комментарии встречается словосочетание "кошелек вебмани". Представьте, что таких сообщений ну очень много, а значит и это словосочетание встречается слишком большое количество раз. Поисковые системы, видя, что какое-то слово или фраза повторяются слишком часто и имеют просто излишне высокую плотность, могут решить, что вы злонамеренно спамите свою страницу, пытаясь вывести ее на первые позиции именно по этому запросу, и могут применить санкции к этой страничке. 

Вывод, комментарии на сайте бывают очень полезными, если следить за их содержанием - вовремя удалять спам и комментарии, не относящиеся к теме конкретной статьи, убирать из сообщений ссылки, ведущие на чужой сайт, либо просто делать их неактивными или не прямыми. Также не стоит допускать в сообщениях большое количество смайликов (или комментарии без текста, полностью состоящие из смайлов). Нельзя, чтобы различные знаки препинания выглядели как частокол (есть любители ставить в конце предложений с десяток вопросительных или восклицательных знаков). Слова в сообщениях не должны быть написаны с использованием только заглавных букв (исключением могут являться общепринятые аббревиатуры, которые пишутся именно заглавными). Если обсуждений какой-нибудь статьи становится слишком много, и становится трудно отслеживать информацию, можно просто отключить функцию добавления комментариев на этой странице, и дальнейшее добавление будет невозможным.

Некоторые вебмастера очень хотят, чтобы посетители оставляли комментарии на их сайте, чтобы показать остальным, что сайт живет и интересен другим, а также чтобы улучшить позиции в поисковой выдаче. Кроме того, как было написано выше, таким образом вебмастер может получить дополнительный контент, ведь пользователи будут бесплатно наполнять его сайт новой информацией. Но как сделать, чтобы попавшие на сайт люди писали сообщения? Если у вас есть такая необходимость, то можно просто заказать на Адвего - бирже покупки и продажи сообщений и комментариев для блогов и форумов несколько десятков осмысленных комментариев к своим статьям, причем довольно недорого. И тогда, возможно, другие пользователи, увидев, что здесь общается много людей, захотят присоединиться к обсуждению. 

А вообще, изначально комментарии необходимы для того, чтобы пользователи могли поделиться своими мыслями по поводу статьи, помочь другим разобраться по теме, дополнить или поправить, если информация неправильная, и даже высказать объективную критику.